近日,來自全世界的一群頂級科學(xué)家齊聚倫敦,討論一項雄心勃勃的全球合作計劃——創(chuàng)建一個人類細胞圖譜(HumanCellAtlas)。這一計劃的目的是希望破譯出人體中每個細胞的類型和特性,構(gòu)建健康人體的參考圖,從而加速生物醫(yī)學(xué)進展,比如了解人類為什么會生病。
意義堪比人類基因組計劃
這次會議由MIT和哈佛醫(yī)學(xué)院BroadInstitute以及WellcomeTrustSangerInstitute召集,由國際專家共同決定人類細胞圖譜計劃第一階段的要素。一些科學(xué)家認為,這一計劃的重要性堪比當(dāng)年首個人類DNA序列的人類基因組計劃(HumanGenomeProject)編制的意義。
GSK高級副總裁、中國研發(fā)中心總經(jīng)理利民表示:“這是一項偉大的學(xué)術(shù)項目!而且即便使用今天的技術(shù),它的意義仍然是深遠的?!?/span>
項目的倡導(dǎo)者之一、MIT計算生物學(xué)家AvivRegev博士表示:“啟動這樣一個項目主要希望對人類有清晰的自我認識。我們希望了解人類是如何構(gòu)成的。最終,這個人類細胞圖譜將有助于徹底改變醫(yī)生和研究人員如何理解、診斷和治療疾病。”
通過把細胞圖譜免費開放給全世界,科學(xué)家希望將研究結(jié)果轉(zhuǎn)化為我們對身體發(fā)育和疾病進展的理解,如哮喘、阿爾茨海默病和癌癥等。將來,這個參考圖也可以指明新的診斷工具和治療方法。
Regev博士指出,對健康人體中所有細胞的準確理解將在未來幾十年影響生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的幾乎每一個方面。我們現(xiàn)在有工具來了解我們?nèi)梭w的組成,了解我們的身體如何工作,并揭示所有這些元素在疾病中的作用。他說:“通過開放的國際合作創(chuàng)建這個圖譜,我們正在為整個社區(qū)建立一個新的研究工具?!?/span>
細胞是生命的基本單位,它們在胚胎中分裂、生長并獲得不同的功能,最終形成不同細胞類型(例如皮膚細胞、神經(jīng)元或脂肪細胞),從而形成身體的各種組織。這些組織匯聚在一起形成器官,例如心、肺、腦、腎臟和肝臟。按照醫(yī)學(xué)教科書的說法:“人體由數(shù)萬億細胞構(gòu)成,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的細胞種類有200多種?!辈贿^真實的數(shù)據(jù)毫無疑問會比這個數(shù)字要高很多。
目前人類基因圖譜的第一個試點性的研究已經(jīng)開啟。單細胞基因組學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)進步,讓科學(xué)家們可以從不同的組織和器官中分離單個細胞,并測量每個細胞的轉(zhuǎn)錄組或其他重要分子,在過去,測量這種復(fù)雜和廣泛的信息幾乎是不可能的。
以前科學(xué)家們通過顯微鏡下觀察和了解細胞,近些年可以通過分析數(shù)百到數(shù)千個細胞的團塊并找到它們的平均性質(zhì)。然而,盡管大多數(shù)細胞所攜帶的基因密碼是相同的,但是它們的命運是被內(nèi)部激活它們的基因排序所左右的。如果調(diào)整基因組中的一組基因,那么細胞就會變成神經(jīng)細胞;激活另外一組基因,細胞就變成了跳動的心臟細胞。為了認清每種細胞類型的真實面目,有必要首先分離細胞,然后找出在每個細胞中產(chǎn)生什么分子。這些分子包含了轉(zhuǎn)錄組,一種將細胞與體內(nèi)其他細胞類型區(qū)分開的物質(zhì)。
應(yīng)用前景何在
利民負責(zé)了整個GSK的全球腦神經(jīng)藥物的研發(fā)。他對記者表示:“人類細胞圖譜未來的應(yīng)用前景廣闊,有三點可以考慮:首先繪制這份重要組織圖無論是對于學(xué)術(shù)認知還是人體健康都具有積極意義;其次它對了解疾病細胞與健康細胞同樣重要;最后是必須盡快找到一種方法能夠把工業(yè)和社會聯(lián)系起來,讓科研領(lǐng)域的進步和社會進步擁有同一個目標,從而幫助改善人類的健康狀況?!?/span>
一些科學(xué)家認為,人類細胞圖譜或許對于用細胞療法來重新產(chǎn)生缺失或受損組織的作用是無價的,它能夠為目前一些不治之癥提供治療方案。比如帕金森,這種疾病是由于大腦持續(xù)缺失能夠產(chǎn)生一種叫做多巴胺的化學(xué)物質(zhì)的神經(jīng)元而導(dǎo)致的。未來的一種治療可能性是在實驗室生產(chǎn)新鮮的能夠產(chǎn)生多巴胺的細胞,然后再把它們注入人腦。
“人類細胞圖譜的意義在于能夠讓科學(xué)家做出判斷,把正確的細胞植入人腦?!彼沟赂鐮柲arolinskaInstitute的神經(jīng)學(xué)家StenLinnarsson表示,“人類細胞圖譜是生命科學(xué)領(lǐng)域很長一段時期以來最為振奮人心的提案,對于健康和疾病而言,細胞是生命最基礎(chǔ)的組成部分,只有對細胞有清晰的了解,才能夠了解病理機制,提供有效的治療方案。”
Regev博士和Teichmann博士所倡導(dǎo)的這樣一份人類細胞圖譜已經(jīng)獲得了來自扎克伯格和妻子PriscillaChan的支持。而要真正建立起這樣一幅圖譜,全球的實驗室必須聯(lián)合起來。而一旦這幅圖譜被繪制出來,研究人員將不僅僅能夠發(fā)現(xiàn)人體細胞的全部種類,而且能確切地找到它們在哪些器官起作用。
不過,花如此大的力氣打造這樣一個世界級的項目,到底為了什么?有科學(xué)家對此提出質(zhì)疑。美國冷泉港腦神經(jīng)學(xué)家AnthonyZador對記者表示:“擁有足夠的資源(主要是資金),要繪制出人體所有的細胞類型并不困難。所以我擔(dān)心的并不是這能不能實現(xiàn)的問題,而是在全球科研經(jīng)費如此有限的背景下,這是不是最好的投資。因為和人類基因組計劃的編制帶有很強的目的性不同,人類細胞圖譜的用途并不明確。還有很多同樣重量級的科研項目等待資金注入,那些項目或許更有實際意義。”
在Zador看來,人類基因組計劃(HumanGenomeProject)的編制對于現(xiàn)代生物學(xué)的意義是革命性的,不僅僅是因為它所產(chǎn)生的數(shù)據(jù),更是因為它撬開了現(xiàn)代基因組排序技術(shù)的奧秘。相比而言,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)的項目讓人失望,這個項目主要是在人類全基因組范圍內(nèi)找出存在的序列變異,從而為研究復(fù)雜疾病提供數(shù)據(jù)分析支撐。“GWAS項目花了巨大的資金,但是結(jié)果并沒有獲得同等的產(chǎn)出,還不如多投一些小的項目?!盳ador對記者表示,“人類細胞圖譜最后會具體落到哪個領(lǐng)域,現(xiàn)在也還不清楚?!?/span>
巧合的是,Zador正在做的一項研究也是繪制一幅“云圖”,不過是人腦圖譜。他的團隊通過一項名為MAP-seq的新技術(shù),利用RNA“條形碼”能夠繪制出人腦約850億個神經(jīng)元細胞之間多達15萬億種連接,有望實現(xiàn)深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的重大突破。
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